网站优化存在的问题主要包括以下几个方面：

1. 内容质量不高：网站内容质量不高、重复、浅显、无价值等问题会影响用户体验和搜索引擎排名。

2. 网站结构混乱：网站结构不清晰、导航不明确、页面深度过大等问题会导致搜索引擎无法有效爬取网站内容。

3. 页面加载速度慢：网站页面加载速度慢会导致用户流失率增加，同时也会影响搜索引擎对网站的评价。

4. 缺乏关键词优化：网站缺乏关键词优化会导致搜索引擎无法准确理解网站内容，从而影响排名。

5. 外部链接质量低：外部链接质量低、大量垃圾链接等问题会影响网站的权威性和排名。

6. 移动端适配不佳：网站在移动端显示效果不佳、加载速度慢等问题会影响用户体验和搜索引擎排名。

7. 缺乏社交化传播：网站缺乏社交化传播，缺乏社交媒体渠道的推广会影响网站的流量和曝光度。

网站优化存在的问题主要包括内容质量、网站结构、页面加载速度、关键词优化、外部链接质量、移动端适配和社交化传播等方面。针对这些问题，网站优化工作需要综合考虑，制定相应的优化策略和措施，以提升网站的用户体验和搜索引擎排名。